D. Yu. Ryazantsev, E. M. Chudinova, L. Yu. Kokaeva, S. N. Elansky, P. N. Balabko, G. L. Belova, S. K. Zavriev
Il-fungus fitopatoġeniku Colletotrichum coccodes jikkawża mard perikoluż fil-patata u t-tadam magħruf bħala anthracnose u tuber black spot. Permezz ta 'karatteristiċi morfoloġiċi, ħafna drabi huma diffiċli biex tiddistingwihom minn mard ikkawżat minn mikroorganiżmi oħra; fuq frott aħdar tat-tadam, il-marda tista 'tkun mingħajr sintomi, u tidher biss fuq frott aħmar misjur. Għal dijanjosi mgħaġġla u preċiża tal-patoġen, hija offruta sistema tat-test PCR f'ħin reali. Biex tiġi żviluppata sistema tat-test, ġiet determinata s-sekwenza tan-nukleotidi tal-ġene glycerol triphosphate dehydrogenase ta '45 C. razez coccodes iżolati minn tuberi tal-patata f'reġjuni differenti tar-Russja.
Ibbażat fuq ir-riżultati miksuba u l-analiżi ta 'sekwenzi simili ta' speċi oħra disponibbli fid-database GenBank, ġew iddisinjati primers u sonda speċifiċi għall-ispeċi għal C. coccodes. Biex tiċċekkja l-ispeċifiċità tas-sistema tat-test maħluqa, PCR twettqet b'DNA iżolata minn kulturi puri ta '15-il speċi differenti ta' fungi parassitiċi u saprotrofiċi assoċjati ma 'pjanti tat-tadam u tal-patata (Fusarium oxysporum, F. verticillium, Phomopsis phaseoli, Alternaria alternata, Helminthosporium solani, Colletotrichum coccodes Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Helminthosporium solani, Phomopsis phaseoli, Neonectria radicicola, Rhizoctonia solani, Penicillium sp., Cladosporium fulvum, C. cladosporioides). Il-preżenza ta ’Colletotrichum coccodes DNA ġiet determinata f’ċiklu ta’ limitu ta ’20-27, filwaqt li speċijiet oħra ġew skoperti wara 40 ċiklu jew ma nstabux. Is-sistema tat-test tagħmilha possibbli li tiskopri b'mod affidabbli konċentrazzjonijiet ta 'C. coccodes DNA li jaqbżu 0.01 ng / mm3 fit-taħlita analizzata tal-PCR. Bl-użu tas-sistema tat-test żviluppata, ġiet investigata l-preżenza ta 'C. coccodes fil-weraq tat-tadam b'sintomi ta' mard fungali u f'tuberi tal-patata mingħajr sintomi esterni tal-marda. Weraq b'sintomi ta 'infezzjoni fungali nġabru minn żewġ għelieqi differenti fit-Territorju ta' Krasnodar, tuberi - minn għelieqi fir-reġjuni ta 'Kostroma, Moska, Kaluga, Nizhny Novgorod. Werqa waħda tat-tadam li fiha C. coccodes DNA instabet fit-Territorju ta 'Krasnodar; preżenza sinifikanti ta 'DNA ta' dan il-patoġenu nstabet f'5 kampjuni ta 'tuberi mkabbra fir-reġjuni ta' Kostroma, Moska, Kaluga.
Introduzzjoni
Fungi tal-ġeneru Colletotrichum huma fitopatoġeni perikolużi li jaffettwaw ċereali, ħxejjex, ħxejjex aromatiċi, frott perenni u pjanti tal-berry. Waħda mill-ispeċi kullimkien ta 'dan il-ġeneru, Colletotrichum coccodes (Wallr).
Hughes, huwa l-aġent kawżattiv ta 'l-anthracnose u l-post iswed ta' patata u tadam, u jikkawża mard ta 'numru ta' pjanti oħra tal-familja Solanaceae, inkl. ħaxix ħażin (Dillard, 1992). C. coccodes jinfetta l-partijiet kollha taħt l-art tal-pjanta, bażijiet taz-zokk, weraq u frott (Andrivon et al., 1998; Johnson, 1994). Fuq il-qoxra ta 'tuberi tal-patata infettati, huwa osservat l-iżvilupp ta' tikek griżi bi trufijiet ippronunzjati b'mod ċar, li fuqhom tikek suwed ta 'sporulazzjoni u mikrosklerotja huma viżibbli b'mod ċar. Matul il-ħażna, ulċeri b'kontenut imrattab jistgħu jiffurmaw fil-polpa tat-tuberi, i.e. il-marda tidħol fil-fażi ta 'l-anthracnose, li, madankollu, hija estremament rari.
Fl-istess ħin, is-sintomi tal-anthracnose (ulċeri fil-ġilda b'punti żgħar suwed) huma tipiċi fuq frott tat-tadam. Fuq il-weraq, is-sintomi ta 'C. coccodes jidhru bħala tikek kannella skuri, ġeneralment imdawra b'tessut isfar (Johnson, 1994).
L-iżvilupp ta 'tikka sewda fuq it-tuberi jħassar id-dehra tagħhom, li hija partikolarment evidenti meta tinbiegħ patata tal-ġilda ħamra maħsula. It-tqaxxir tal-qoxra jwassal għal evaporazzjoni żejda u żieda fit-telf tal-ħażna (Hunger, McIntyre, 1979). Ħsara lil organi oħra tal-pjanti twassal għal telf ta 'rendiment, li ġie nnutat kemm f'art miftuħa kif ukoll magħluqa (Johnson, 1994; Tsror et al., 1999). Mard ikkawżat minn C. coccodes huwa komuni fi kważi r-reġjuni kollha tad-dinja li jipproduċu l-patata, inkluża r-Russja (Leesa, Hilton, 2003; Belov et al, 2018). Il-kontroll ta 'dan il-mard huwa diffiċli minħabba l-effettività insuffiċjenti ta' funġiċidi eżistenti kontra C. coccodes u n-nuqqas ta 'varjetajiet reżistenti (Aqra, Aħbi, 1995).
L-inoculum C. coccodes jista 'jippersisti f'tuberi taż-żerriegħa (Aqra, Aħbi, 1988; Johnson et al., 1997), żrieragħ tat-tadam (Ben-Daniel et al., 2010), jgħixu għal żmien twil fil-ħamrija, fuq fdalijiet tal-pjanti (Dillard, 1990 ; Dillard, Cobb, 1993) u fil-ħaxix ħażin (Raid, Pennypacker, 1987). Ix-xogħlijiet ta 'numru ta' awturi (Aqra, Aħbi, 1988; Barkdoll, Davis, 1992; Johnson et al., 1997; Dillard, Cobb, 1993) urew li l-iżvilupp tal-marda fil-patata u t-tadam jiddependi ħafna fuq il-preżenza ta 'inoculum fiż-żerriegħa u ħamrija. Għalhekk, biex jitnaqqas kemm jista 'jkun it-telf mill-marda, huwa meħtieġ li jiġu djanjostikati (inkluż kwantitattivament) il-propaguli tal-fungus fil-materjal taż-żerriegħa, fil-ħamrija, fit-tuberi taż-żerriegħa tal-patata u ż-żrieragħ tat-tadam imqiegħda għall-ħażna. Dijanjostiċi morfoloġiċi fil-ħamrija u l-materjal tal-pjanti jistgħu jsiru biss bil-preżenza tal-mikrosklerotja, li, madankollu, jinsabu wkoll f'tipi oħra ta 'fungi.
Is-sintomi fuq it-tuberi huma simili ħafna għall-iskorċa tal-fidda kkawżata mill-fungus Helminthosporium solani. L-iżolament ta ’Colletotrichum coccodes u Helminthosporium solani f’kultura pura huwa pjuttost diffiċli u jieħu ħafna żmien minħabba t-tkabbir bil-mod fuq mezz ta’ nutrijent. Biex tidentifika malajr Colletotrichum coccodes, huwa meħtieġ li jintużaw metodi dijanjostiċi strumentali. L-iktar metodu konvenjenti huwa r-reazzjoni katina tal-polimerasa (PCR) u l-modifika tagħha - PCR f'ħin reali. Bħalissa, sistema ta 'test żviluppata minn riċerkaturi Brittaniċi (Cullen et al., 2002) għar-reġjun ITS1 ta' rDNA tintuża fl-Ewropa u l-Istati Uniti. L-użu tiegħu wera riżultati tajbin fl-analiżi ta 'iżolati Russi (Belov et al, 2018). Madankollu, C. coccodes huwa varjabbli ħafna u l-iskoperta tiegħu minn sekwenza ta 'DNA waħda tista' twassal għal riżultati negattivi foloz. Għal dijanjosi aktar affidabbli, analiżi hija meħtieġa għal diversi sekwenzi ta 'DNA speċifiċi għall-ispeċi, li b'konnessjoni magħhom żviluppajna sistema ta' test oriġinali li tippermetti l-identifikazzjoni ta 'C. coccodes bis-sekwenza tal-ġene glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
materjali u metodi
Biex nevalwaw l-effettività u l-ispeċifiċità tas-sistemi tat-test maħluqa, użajna kulturi puri ta ’15-il speċi ta’ fungi iżolati mill-awturi minn kampjuni morda ta ’weraq u frott tat-tadam, tuberi tal-patata (Tabella 1). Għall-iżolament, ittieħdu l-organi tal-pjanti b'sintomi ta 'infezzjoni fungali, mhux aktar minn organu wieħed għal kull arbuxxell.
Porzjon ta 'tuberu bil-qoxra, porzjon ta' frott tat-tadam, u werqa affettwata tqiegħdu taħt mikroskopju binokulari, wara li l-miċelju, l-ispori, jew biċċa tessut ġew trasferiti fuq medju agar (wort agar) f'dixx Petri b'labra ta 'dissezzjoni mqaxxra. L-iżolati kienu maħżuna fuq slender agar f'tubi tat-test f'4 ° C.
Kampjuni ta 'weraq tat-tadam b'sintomi ta' mard fungali, maħsuba għall-analiżi, immedjatament wara l-ġbir (fil-għalqa) tqiegħdu f'70% alkoħol etiliku li fih kienu maħżuna sa iżolament tad-DNA. Tuberi tal-patata ġew ikkunsinnati fil-laboratorju, imqaxxra (biċċa 2 × 1 cm) minnhom, u ffriżati f '–20 ° С. Maħżun iffriżat sal-iżolament tad-DNA.
Kulturi puri ta 'fungi għall-iżolament tad-DNA kienu mkabbra f'medja likwida tal-piżelli. Il-miċelju tal-fungus tneħħa mill-mezz likwidu, imnixxef fuq karta filtru, iffriżat f'nitroġenu likwidu, omoġenizzat, inkubat f'buffer CTAB, ippurifikat bil-kloroform, preċipitat b'taħlita ta 'isopropanol u 0.5 M aċetat tal-potassju, maħsul darbtejn b'2% alkoħol. Id-DNA li tirriżulta ġiet maħlula f'ilma dejonizzat u maħżuna fi –70 ° С (Kutuzova et al., 20). Il-konċentrazzjoni tad-DNA ġiet imkejla bl-użu ta 'kit ta' kwantifikazzjoni tad-DNA HS għal DNA bi stranded double fuq Qubit 2017 (Qiagen, il-Ġermanja). Il-kampjuni alkoħolizzati u ffriżati ġew triturati f'nitroġenu likwidu, imbagħad l-estrazzjoni tad-DNA saret bl-istess mod kif deskritt hawn fuq (għall-miċelju ta 'kulturi fungali puri).
Tabella 1. Oriġini tar-razez tal-fungi użati
Isem il-faqqiegħ | Pjanta, organu | Post tal-għażla |
---|---|---|
Colletotrichum coccodes 1, C. coccodes 2, C. coccodes 3, Ilyonectria crassa, Rhizoctonia solani | tuberu tal-patata | Reġjun Kostroma, tuberi tal-patata tal-ewwel ġenerazzjoni tal-għalqa, il-kultivar Red Scarlett |
Colletotrichum cocodes 4 | weraq tal-patata | Rep. Mari El, Yoshkar-Ola |
Helminthosporium solani | tuberu tal-patata | Reġjun ta 'Magadan, pos. Tinda, tuberu tal-patata |
Cladosporium fulvum | weraq tat-tadam | Reġjun ta 'Moska, tadam ta' frott kbir |
Alternaria tomatophila | frott tat-tadam | sottomess mill-istaff tal-laboratorju tal-mikoloġija u l-fitopatoloġija tal-Istitut tar-Riċerka All-Russian tal-Protezzjoni tal-Pjanti |
Fusarium verticillium, Phomopsisphaseoli, Alternaria alternata, Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Cladosporium cladosporioides, Acrodontium luzulae, Penicillium sp. | frott tat-tadam | Territorju ta 'Krasnodar, distrett ta' Krymsky, grad Krema |
Fusarium oxysporum | għerq tal-qamħ | Reġjun ta 'Moska |
Il-PCR twettqet fuq amplifikatur DTprime (DNA-Technology). Għal PCR, primers oriġinali u sonda għar-reġjun speċifiku għall-ispeċi tal-ġene glycerol triphosphate dehydrogenase intużaw: forward primer Coc70gdf –TCATGATATCATTTCTCTCACGGCA, reverse primer Coc280gdr - TACTTGAGCATGTAGGCCTGGGT1. Il-primers jamplifikaw reġjun ta '213 bp.
Ir-reazzjoni ħadet 50 ng ta 'DNA totali (fl-analiżi ta' weraq u tuberi) u 10 ng (fl-analiżi ta 'DNA ta' kulturi puri ta 'fungi). It-taħlita tar-reazzjoni (35 μl) kienet separata b'saff ta 'paraffin f'żewġ partijiet: l-iktar baxx (20 μl) kien fih 2 μl ta' 10 × buffer tar-reazzjoni (750 mM Tris-HCl, pH 8.8; 200 mM (NH4) 2SO4; 25 mM MgCl2; 0.1% Tween- 20), 0.5 mM ta 'kull trifosfat tad-deossinukleotid, 7 pmol ta' kull primer, u 4 pmol ta 'sonda fluworexxenti idrolisabbli; il-parti ta 'fuq kien fiha 1 μl ta' 10 × PCR buffer u 1 U ta 'Taq polymerase.
Is-separazzjoni tat-taħlita mal-paraffin tippermetti li t-tubi jinħażnu għal żmien twil f'temperatura ta '5 ° C u li jipprovdu bidu sħun għall-PCR wara li jissaħħnu għal 10 min f'temperatura' l fuq minn 80 ° C. Il-PCR sar skont il-programm li ġej: 94.0 ° C - 90 s (ċiklu 1); 94.0 ° C - 30 s; 64.0 ° C - 15 s (5 ċikli); 94.0 ° C - 10 s; 64.0 ° C - 15 s (45 ċiklu); 10.0 ° C - ħażna.
riżultati u diskussjoni
Is-sekwenzi tal-ġene glycerol triphosphate dehydrogenase ġew determinati fi 45 razza iżolati minn weraq, zkuk, tuberi tal-patata, u frott tat-tadam (Kutuzova, 2018) f’reġjuni differenti tar-Russja. Is-sekwenzi investigati tar-razez kollha kienu maqsuma f'2 gruppi differenti f'żewġ nukleotidi. Is-sekwenzi tan-nukleotidi tar-rappreżentanti taż-żewġ gruppi taħt in-numri KY496634 u KY496635 huma depożitati f'GenBank.
Il-primers coc70gdf, coc280gdr u s-sonda cocgdz iddisinjati fuq il-bażi tagħhom ġew ikkontrollati bl-użu tal-programm BLAST (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) fuq is-sekwenzi kollha tal-ġene glycerol triphosphate dehydrogenase ta 'speċi tal-ġeneru Colletotrichum u organiżmi oħra disponibbli fid-database GenBank.
Ma nstabu l-ebda reġjuni tad-DNA ta 'organiżmi oħra omologi ħafna għall-primers u s-sonda.
Is-sensittività tas-sistema tat-test ġiet iċċekkjata bl-użu ta 'kampjuni b'konċentrazzjonijiet differenti ta' C. coccodes DNA, DNA ta 'werqa tal-patata infettata bl-anthracnose (miġbura fl-2017 f'Mari El, varjetà Red Scarlett), u qoxra ta' tuberi affettwati mill-punt iswed (miġbura fir-reġjun ta 'Kostroma, varjetà Red Scarlett, Tabella 2). Biex tikkonferma l-preżenza tad-DNA fit-tuberi u l-weraq tal-patata, ir-razez ta 'C. coccodes ġew iżolati minnhom f'kulturi puri.
Ir-riżultati tal-analiżi tas-sensittività tas-sistema tat-test juru li tista 'tintuża biex tkun iddijanjostikata b'suċċess il-preżenza ta' C. coccodes DNA f'kampjun meta l-kontenut totali tiegħu fit-taħlita tal-PCR huwa aktar minn 0.05 ng. Dan huwa pjuttost biżżejjed għall-iskoperta, peress li sklerotja waħda fiha, bħala medja, 0.131 ng, u spora waħda fiha madwar 0.04 ng ta 'DNA (Cullen et al., 2002). Is-sistema tat-test żviluppata mill-grupp Ingliż (Cullen et al., 2002) uriet sensittività simili (ċiklu limitu 34 f'0.05 ng DNA u 37 f'0.005 ng).
Analiżi ta 'kampjuni naturali li fihom C. coccodes fil-każijiet kollha għamlitha possibbli li tkun żvelata b'mod affidabbli l-preżenza tagħha fil-kampjun (Tabella 2). Il-metodu propost għall-iżolament tad-DNA kien applikabbli wkoll għall-analiżi ta 'kampjuni ta' pjanti naturali.
Tabella 2. Determinazzjoni tas-sensittività tas-sistema tat-test proposta għall-identifikazzjoni tal-coccodes Colletotrichum għall-PCR fil-ħin reali
Kampjun | Ammont tad-DNA fil-kampjun *, ng | Ċiklu tal-limitu | C. sejbien tal-kokkodi |
---|---|---|---|
Mycelium Colletotrichum coccodes | 50 | 21.3 | + |
5 | 25.7 | + | |
0.5 | 29,7 | + | |
0.05 | 33.5 | + | |
0.005 | 40 | - | |
0.0005 | 42.8 | - | |
0.00005 | - | ||
Qoxra tat-tuberu 1 | 50 | 32 | + |
Qoxra tat-tuberu 2 | 50 | 30 | + |
Qoxra tat-tuberu 3 | 50 | 31.5 | + |
Weraq tal-patata | 50 | 29.5 | + |
Nota. * F'taħlita ta 'prodotti PCR.
L-ispeċifiċità tas-sistema tat-test ġiet ittestjata fuq kampjuni tad-DNA estratti minn 15-il speċi ta 'fungi. Ir-razez kollha tal-fungi ġew iżolati mill-awturi minn frott affettwat u b'saħħtu u weraq tat-tadam, tuberi tal-patata; razza waħda ġiet iżolata mill-għerq tal-qamħ (Tabella 1). Fost l-ispeċi iżolati mill-wiċċ tal-frott, hemm ukoll speċi li mhumiex patoġeniċi għat-tadam (per eżempju, Phellinus ferrugineovelutinus).
Studji wrew li d-DNA ta 'C. coccodes ġiet skoperta f'ċiklu ta' limitu ta '20-27, filwaqt li speċi fungali oħra ma nstabux jew taw sinjal wara ċ-ċiklu 40, li jista' jiġi attribwit għal effett ta 'storbju mhux speċifiku (Tabella 3).
Tabella 3. Ittestjar tas-sistema tat-test għal diversi tipi ta 'faqqiegħ
Isem il-faqqiegħ | Ċiklu tal-limitu |
Colletotrichum cocodes 1 | 20.9 |
C. kokkodi 2 | 22.6 |
C. kokkodi 3 | 23 |
C. kokkodi 4 | 22 |
Fusarium oxysporum | > 40 |
F. vertiċillju | > 40 |
Rhizoctonia solani | > 40 |
Phomopsis phaseoli | > 40 |
Alternaria alternata | > 40 |
A. tomatophila | > 40 |
Helminthosporium solani | > 40 |
Phellinus ferrugineovelinus | > 40 |
Stemphylium vesicarium | > 40 |
Ilyonectria crassa | > 40 |
Cladosporium cladosporioides | > 40 |
C. fulvum | > 40 |
Acrodontium luzulae | > 40 |
Peniċillju NS. | > 40 |
Nota. * L-ammont ta 'DNA fil-kampjuni kollha kien 10 ng.
Is-sistema żviluppata tat-test intużat biex tidentifika C. coccodes f'kampjuni tal-weraq tat-tadam b'sintomi ta 'patoġeni nekrotrofiċi u tuberi tal-patata taż-żerriegħa mingħajr sintomi viżibbli. Għall-istudju, ħadna tuberi taż-żerriegħa ta 'varjetajiet differenti mkabbra fir-reġjuni Kostroma, Moska, Kaluga, Nizhny Novgorod. Il-preżenza ta ’C. coccodes DNA kienet ikkunsidrata sinifikanti fil-kampjuni, li fl-analiżi tagħhom iċ-ċiklu tal-limitu ma jaqbiżx il-35. ċikli ta 'limitu' l fuq minn 0.05, ġiet dijanjostikata DNA mhux speċifika ta 'xi speċi oħra ta' fungi. B'dan l-approċċ, il-preżenza sinifikanti ta 'C. coccodes DNA ġiet skoperta f'33.5 kampjuni ta' tuberi mkabbra fir-reġjuni Kostroma, Moska, Kaluga u f'weraq wieħed tat-tadam mir-reġjun Yeisk tar-reġjun Krasnodar (Tabelli 2, 40).
Tabella 4. Sejbien ta 'coccodes Colletotrichum fuq tuberi tal-patata *
Numru tal-kampjun | Varjetà ta 'patata | Post tat-tkabbir | C. sejbien tal-kokkodi | Ċiklu tal-limitu |
---|---|---|---|---|
1 | Iskarlatina Ħamra | Reġjun Kostroma | + | 35 |
2 | + | 35 | ||
3 | - | 38 | ||
4 | Sante | Reġjun ta 'Moska | + | 34 |
5 | - | |||
6 | - | 41 | ||
7 | - | 41.8 | ||
8 | + | 30 | ||
9 | Zhukovsky kmieni | Reġjun ta 'Moska | - | 40.5 |
10 | - | 40.6 | ||
11 | - | |||
12 | Molly | reġjun Kaluga. | + | 34.3 |
13 | - | 38.4 | ||
14 | Fantasija | reġjun Kaluga. | - | |
15 | Gala | reġjun Nizhny Novgorod. | - | |
16 | - |
Nota. * L-ammont ta 'DNA fil-kampjuni kollha kien 50 ng.
Tabella 5. Sejbien ta 'coccodes Colletotrichum fuq weraq tat-tadam *
Numru tal-kampjun | Post tat-tkabbir | C. sejbien tal-kokkodi | Ċiklu tal-limitu |
---|---|---|---|
1 | Territorju ta 'Krasnodar, Distrett tal-Krimea | - | |
2 | - | ||
3 | - | ||
4 | - | 45 | |
5 | - | ||
6 | - | ||
7 | - | ||
8 | - | ||
9 | Territorju ta 'Krasnodar, Distrett ta' Yeisk | - | 39.2 |
10 | - | 40.8 | |
11 | - | ||
12 | - | 41.6 | |
13 | - | 40 | |
14 | - | 41 | |
15 | - | 41.9 | |
16 | - | ||
17 | - | ||
18 | - | 40.3 | |
19 | - | ||
20 | - | ||
21 | + | 34.5 | |
22 | - | ||
23 | - |
* L-ammont ta 'DNA fil-kampjuni kollha kien 50 ng.
Is-sistema tat-test maħluqa minna mhijiex inferjuri għal dik żviluppata minn riċerkaturi Ingliżi (Cullen et al., 2002) fis-sensittività u l-ispeċifiċità u hija adattata għall-analiżi tal-kampjuni tal-pjanti. L-applikazzjoni tagħha għall-analiżi tat-tuberi taż-żerriegħa għamlitha possibbli li tidentifika C. coccodes DNA fit-tuberi mingħajr sinjali esterni ta 'ħsara u li tanalizza b'suċċess l-infezzjoni tal-weraq.
Sal-lum, l-ebda analiżi tat-tuberi tal-patata għall-infestazzjoni ta 'C. coccodes ma saret fir-Russja. L-ewwel studju tagħna wera li minn 16-il tuberu taż-żerriegħa ttestjati mkabbra f'reġjuni differenti tal-Federazzjoni Russa, 5 fihom C. coccodes. Dan juri li l-post iswed tat-tuberi tal-patata huwa marda komuni tal-patata fir-Russja, u r-rwol tagħha fit-tnaqqis tal-volum u l-kwalità tal-wiċċ tal-patata huwa sottovalutat.
Analiżi tal-weraq tat-tadam żvelat preżenza sinifikanti ta 'DNA ta' C. coccodes f'weraq wieħed mid-distrett ta 'Yeisk tat-Territorju ta' Krasnodar. Qabel, meta eżaminat l-għelieqi tat-tadam fin-Nofsinhar tar-Russja bl-użu tas-sistema tat-test Ingliża (Cullen et al., 2002), instabu weraq li fihom C. coccodes, u f'xi għelieqi nstab proporzjon għoli ta 'weraq infettati bis-C. coccodes (Belov et al., 2018). Fit-Territorji ta 'Krasnodar u Primorsky, ir-Reġjun ta' Moska, sibna frott tat-tadam, li minnu rnexxielna niżolaw kulturi puri ta 'C. coccodes. Huwa possibbli li C. coccodes huwa ħafna iktar mifrux fuq it-tadam fir-Russja milli hu maħsub issa, u l-ħsara tiegħu hija wkoll sottovalutata.
Għalhekk, sal-lum, ġiet akkumulata biżżejjed informazzjoni dwar id-distribuzzjoni mifruxa ta 'C. coccodes fuq il-patata u t-tadam.
Biex tifhem aħjar ir-rwol ta ’dan il-fungus fl-iżvilupp ta’ mard tal-patata u tat-tadam, huwa meħtieġ li tiġi mmonitorjata l-prevalenza tiegħu fir-Russja, jiġi studjat ir-rwol tal-infezzjonijiet tal-ħamrija u taż-żerriegħa, u r-rwol tal-punt iswed fit-telf waqt il-ħażna. L-użu ta 'dijanjostiċi PCR jista' jiffaċilita b'mod sinifikanti dan ix-xogħol, u l-użu simultanju taż-żewġ sistemi tat-test iżid b'mod sinifikanti l-eżattezza ta 'l-analiżi.
Dan ix-xogħol kien appoġġat mill-għotja Nru 18-76-00009 tal-Fondazzjoni tax-Xjenza Russa.
L-artiklu ġie ppubblikat fil-ġurnal "Mycology and Phytopathology" (volum 54, Nru 1, 2020).